如果您是营养师资格证的申请者，并且遇到了机构拒绝发放证书的情况，您可以采取以下步骤进行投诉：

1、收集证据：首先确保您有足够的证据来支持您的投诉，这可能包括您的个人信息、申请表格、通信记录（如邮件往来）、以及任何其他相关文件或资料。

2、了解政策和程序：在正式投诉之前，先查阅该机构的投诉政策和程序，不同机构对于投诉的处理方式可能会有所不同，了解这些信息可以帮助您更有效地提出问题。

3、书面投诉：通过官方渠道提交书面投诉，这通常意味着通过电子邮件或邮寄的方式向机构的客户服务部门发送正式投诉信，在信件中，清晰地陈述您的诉求、提供的证据以及为何认为该机构没有履行其职责。

4、电话投诉：如果机构设有客服热线，您可以尝试通过电话进行投诉，准备好详细描述您的问题和期望的解决方案。

5、面对面沟通：如果有可能，尝试与负责此案件的工作人员直接沟通，面对面的交流可以更快地解决问题。

6、社交媒体和在线论坛：如果其他方法无效，可以考虑在社交媒体平台或相关的在线论坛上公开您的经历，这样做可能会引起更多人的关注，并促使机构采取行动。

7、消费者保护组织：如果上述途径都无法解决问题，您可以考虑联系当地的消费者保护组织，这些组织通常有专门的程序来处理消费者投诉，并可能能提供额外的帮助。

8、法律途径：作为最后的手段，您可以考虑咨询律师，了解是否有必要通过法律途径来解决这一问题，不过，在此之前，请确保您已经尝试了所有可行的解决方案。

在进行投诉时，保持冷静和专业的态度是非常重要的，确保您遵循正确的程序和时间线，以便您的投诉能够得到适当的处理。