心理指导师证书是由各个国家和地区的专业机构或教育机构颁发的，具体发证机构因地区而异，心理指导师证书主要由以下几个部门颁发：

1、中国心理卫生协会：中国心理卫生协会(CPA)是一个全国性的专业组织，成立于1953年，它是中国心理学界的权威机构之一，负责组织和推动心理学的发展，CPA设有心理咨询与治疗专业委员会，负责心理咨询师、心理治疗师等职业资格的认证工作，获得CPA认证的心理指导师可以在国内外从事心理咨询、心理治疗等工作。

2、各省市心理学会：各省市心理学会是地方性的心理专业组织，它们通常与当地的教育部门、卫生部门等合作，共同推动心理学的发展，各省市心理学会也会组织心理咨询师、心理治疗师等职业资格的认证工作，在这些地区获得心理指导师证书的人，可以在本地区从事心理咨询、心理治疗等工作。

3、国际认证机构：除了国内的认证机构外，还有一些国际性的认证机构也提供心理指导师证书，美国心理治疗协会(APA)颁发的临床心理治疗师(LCPC)证书；英国皇家精神病学协会(RCGP)颁发的临床精神科医生(GPC)证书等，这些国际认证机构的证书在全球范围内具有较高的认可度，可以为持有者提供更广泛的职业发展机会。

4、教育机构：一些大学、研究所等教育机构也会开设心理咨询、心理治疗等相关课程，并颁发相应的证书，这些证书通常需要学生完成一定的课程学习、实习等要求，具有一定的学术性和专业性。

心理指导师证书的发证机构因地区和需求而异，可以选择符合自己需求和条件的机构进行学习和考试，在选择培训机构或发证机构时，建议注意以下几点：

1、了解该机构或组织的背景和声誉，确保其具备专业的资质和认证能力。

2、了解该证书的具体内容和要求，确保其符合自己的职业发展规划和实际需求。

3、注意证书的有效期和更新机制，确保自己始终具备最新的职业资格。

4、在求职或开展职业活动时，注意向雇主或相关机构说明自己所持有的心理指导师证书的发证机构和具体情况，以便他们了解您的专业背景和资质。