心理咨询师证书发放机构是指负责管理和颁发心理咨询师资格证书的组织，这些机构通常由国家或地方政府设立，或者是由具有资质的行业协会、专业学会等非政府组织承担，心理咨询师证书发放机构主要包括以下几种：

1、人力资源和社会保障部(原劳动和社会保障部):人力资源和社会保障部是国家级政府部门，负责制定和管理全国范围内的职业资格证书制度，根据相关法律法规，人力资源和社会保障部负责颁发心理咨询师资格证书。

2、各省、自治区、直辖市人力资源社会保障厅(局):各省、自治区、直辖市人力资源社会保障厅(局)在人力资源和社会保障部的指导下，负责本辖区内心理咨询师证书的颁发工作，各地人力资源社会保障厅(局)会定期组织心理咨询师考试，并对合格者颁发资格证书。

3、行业协会、专业学会：有一些行业协会和专业学会也承担着心理咨询师证书发放的工作，中国心理卫生协会、中国心理学会等组织会在相关领域开展培训和考试活动，对合格者颁发心理咨询师证书。

4、高校、科研机构：部分高校和科研机构也会开设心理咨询相关的课程和培训项目，对学生和教职工进行系统化的心理咨询知识和技能培训，培训合格者可以获得学校或科研机构颁发的心理咨询师证书。

5、社会培训机构：随着心理咨询行业的发展，越来越多的社会培训机构应运而生，这些机构通过举办各类心理咨询培训班、研讨会等活动，为学员提供专业的心理咨询知识和技能培训，部分社会培训机构也会颁发心理咨询师证书，但这种证书的含金量和认可度相对较低。

6、国际认证机构：除了国内的心理咨询师证书发放机构外，还有一些国际认证机构也在中国提供心理咨询师认证服务，美国心理治疗协会(APA)推出的“临床心理治疗师认证”(Certifite in Clinil Psychology)等项目，这些国际认证机构的证书在国际上具有一定的认可度，但在国内的实用性和权威性有限。

心理咨询师证书发放机构有很多种，包括国家级政府部门、地方人社部门、行业协会、高校科研机构等，在选择心理咨询师证书发放机构时，建议考生关注机构的资质、声誉和服务质量，以确保所获得的证书具有较高的认可度和实用性，考生还可以通过查阅相关政策文件、咨询专业人士等方式，了解各证书发放机构的具体要求和流程，为自己的专业发展打下坚实的基础。