婚姻家庭咨询师证书是由国家相关部门颁发的专业资格证书，用于证明持证人具备从事婚姻家庭咨询工作的能力和水平，婚姻家庭咨询师证书的颁发主要由以下几个部门负责：

1、国家卫生健康委员会（National Health Commission，简称NHC）：国家卫生健康委员会是中国国务院组成部门，主要负责全国卫生和健康工作的领导、管理和监督，在婚姻家庭咨询领域，国家卫生健康委员会主要负责制定相关政策、法规和标准，以及对婚姻家庭咨询师的培训、考核和认证工作进行指导和监督。

2、地方卫生健康行政部门：各省、自治区、直辖市卫生健康行政部门是负责本行政区域内卫生和健康工作的地方政府部门，在婚姻家庭咨询领域，地方卫生健康行政部门主要负责组织实施本地区的婚姻家庭咨询师培训、考核和认证工作，以及对本地区婚姻家庭咨询机构和从业人员的管理。

3、专业培训机构：为了提高婚姻家庭咨询师的专业素质和能力，各级政府和相关部门鼓励和支持各类专业培训机构开展婚姻家庭咨询师培训工作，这些培训机构需要具备一定的资质和条件，如具备一定数量的专业教师、教学设施和教学资源等，经过培训并考核合格的学员，可以获得婚姻家庭咨询师证书。

4、行业协会和学会：中国婚姻家庭咨询行业协会和各省级婚姻家庭咨询行业协会是婚姻家庭咨询行业的自律组织，主要负责行业内的技术交流、学术研究、职业培训和行业管理等工作，这些协会和学会也会组织开展婚姻家庭咨询师的培训和认证工作，对于通过培训和考核的学员，可以颁发婚姻家庭咨询师证书。

婚姻家庭咨询师证书的颁发程序一般包括以下几个步骤：

1、报名参加培训：具备一定条件的人员可以报名参加婚姻家庭咨询师培训课程，报名时需要提交相关材料，如身份证明、学历证明、工作经历证明等。

2、参加培训：培训课程通常包括理论学习、实践操作和案例分析等内容，旨在提高学员的婚姻家庭咨询知识和技能。

3、参加考核：培训结束后，学员需要参加由培训机构或相关部门组织的考核，考核形式通常包括笔试、面试和实践操作等，以检验学员的学习成果和实际操作能力。

4、获得证书：考核合格后，学员可以获得婚姻家庭咨询师证书，证书上会注明学员的姓名、性别、出生日期、证书编号、发证单位等信息。

5、持续教育和注册：婚姻家庭咨询师需要定期参加继续教育，更新知识和技能，以保持专业素质，婚姻家庭咨询师还需要在相关部门进行注册，以便接受行业监管和管理。

婚姻家庭咨询师证书的颁发涉及多个部门和机构，包括国家卫生健康委员会、地方卫生健康行政部门、专业培训机构和行业协会等，学员需要按照规定的程序参加培训、考核，才能获得婚姻家庭咨询师证书。