高级农艺师证书是由国家农业农村部颁发的，是农业领域中的一种专业技能人才资格证书，该证书的颁发旨在提高农业生产效率、保障农产品质量安全、促进农业可持续发展等方面发挥重要作用。

目前，国内有很多机构可以提供高级农艺师培训和考试服务，包括农业大学、农业技术推广站、农业企业等，不同的机构在师资力量、教学质量、考试难度等方面存在差异，因此选择哪个部门颁发的高级农艺师证书更好需要根据个人情况而定。

建议选择有资质的正规机构进行培训和考试，这些机构通常具有一定的教学经验和师资力量，能够提供系统化的教学内容和实践操作指导，有助于提高学员的专业技能水平，这些机构的教学质量和考试难度也相对较高，能够更好地保证学员获得高级农艺师证书的真实性和权威性。

可以考虑机构的历史和口碑，一些老牌的农业大学或者农业技术推广站由于长期从事农业教育和技术推广工作，积累了丰富的教学经验和资源，因此在高级农艺师培训和考试方面也有一定的优势，可以通过查看机构的官方网站、用户评价等方式了解机构的口碑和服务质量，以便做出更明智的选择。

还需要考虑个人的实际需求和预算等因素，不同的培训机构收费不同，有些机构可能提供更加个性化的服务和辅导，但相应的收费也会更高一些，在选择机构时需要综合考虑自己的实际情况和经济能力，选择适合自己的培训机构。

高级农艺师证书的颁发部门并没有绝对的好坏之分，关键在于选择一个合适的机构进行学习和考试，希望以上内容能够对您有所帮助！