针灸师证书的发放和认证是确保针灸师具备专业技能和知识的重要途径，在不同的国家和地区，针灸师证书的发放机构和标准可能有所不同，针灸师证书主要由以下几个部门发放：

1、人力资源和社会保障部(原劳动和社会保障部):该部门负责制定和管理针灸师职业资格证书的颁发政策，在申请针灸师证书时，需要通过国家职业资格考试，考试内容包括中医基础理论、针灸技能等，考试合格后，由人力资源和社会保障部颁发针灸师职业资格证书。

2、国家中医药管理局：作为中医药行业的主管部门，国家中医药管理局负责对针灸师的专业技能和知识进行监管和指导，在一定范围内，具有针灸师职业资格证书的人员可以被认定为具备一定的专业水平。

3、各省、自治区、直辖市中医药管理部门：在各地，中医药管理部门也会负责针灸师证书的发放和管理，具体的发放流程和要求可能因地区而异，通常需要提供相关材料并经过审核。

4、中医药院校：部分中医药院校会开设针灸专业，并在校内进行针灸师职业资格考试，考试合格的学生可以获得学校颁发的针灸师证书，但这种证书的含金量相对较低，因为它并未得到人力资源和社会保障部或国家中医药管理局的认证。

5、其他培训机构：除了正规的中医药院校外，还有一些培训机构提供针灸师培训课程，这些课程结束后，学员可以参加由培训机构组织的针灸师职业资格考试，虽然这类证书的权威性不如前述几种证书，但对于一些对针灸师资格要求不高的场合，如社区诊所等，这类证书可能仍然具有一定的认可度。

要获得有效的针灸师证书，最好是通过人力资源和社会保障部或国家中医药管理局的认证，这意味着需要通过国家职业资格考试，考试内容涵盖中医基础理论、针灸技能等方面，还需要注意各地区的发放要求和流程，以确保证书的有效性。