正骨整脊师证书发证机构主要是指那些具有权威性的、能够对正骨整脊师的专业技能和知识进行认证的单位，这些单位通常包括医学院校、卫生部门、专业协会等，正骨整脊师证书的发证机构主要有以下几个：

1、中国中医科学院：中国中医科学院是中国最高学术机构和全国中医药科研、教育、医疗、预防、康复、保健等综合性研究机构，该院设有多个研究所，如针灸研究所、推拿研究所等，这些研究所负责正骨整脊师的专业培训和技能认证工作。

2、国家卫生健康委员会：国家卫生健康委员会是中华人民共和国国务院组成部门，负责全国卫生健康工作的管理和监督，该委员会下设多个司局，如卫生监督局、中医药管理局等，这些司局负责正骨整脊师证书的颁发和管理。

3、中国民间中医医药研究会：中国民间中医医药研究会是一个全国性的民间中医医药学术组织，旨在弘扬和发展中华民族传统医学，该会设有正骨整脊专业委员会，负责正骨整脊师的专业培训和技能认证工作。

4、中国中医药学会：中国中医药学会是一个全国性的中医药学术组织，旨在推动中医药事业的发展，该会设有正骨整脊专业委员会，负责正骨整脊师的专业培训和技能认证工作。

5、中国针灸推拿协会：中国针灸推拿协会是一个全国性的针灸推拿学术组织，旨在推动针灸推拿事业的发展，该协会设有正骨整脊专业委员会，负责正骨整脊师的专业培训和技能认证工作。

6、中国正骨推拿研究院：中国正骨推拿研究院是一个专门从事正骨推拿技术研究和人才培养的机构，该研究院设有正骨整脊师培训班，负责正骨整脊师的专业培训和技能认证工作。

7、各省市卫生厅局：各省市卫生厅局在地方层面也设有正骨整脊师证书的发证机构，负责本地区正骨整脊师的专业培训和技能认证工作。

8、各地中医院校：各地中医院校作为中医药教育的重要基地，也承担着正骨整脊师的专业培训和技能认证工作，例如北京中医药大学、上海中医药大学、广州中医药大学等。

9、其他专业培训机构：除了以上提到的单位外，还有一些专业的正骨整脊师培训机构，如北京华夏医院、上海华美医疗美容医院等，这些机构也负责正骨整脊师的专业培训和技能认证工作。

正骨整脊师证书发证机构主要包括医学院校、卫生部门、专业协会等多方面的力量，这些单位共同构成了一个完整的体系，对正骨整脊师的专业技能和知识进行全方位的认证，确保了正骨整脊师的专业素质和水平。