心理咨询师资格证的发放主要由国家卫生健康委员会(原卫生部)负责，自2017年起，国家卫生健康委员会开始实施心理咨询师职业资格认证制度，对参加心理咨询师培训并通过考试的人员颁发心理咨询师资格证书。

心理咨询师资格证的发放机构主要有以下几个：

1、国家卫生健康委员会(原卫生部):作为心理咨询师资格证的主管部门，国家卫生健康委员会负责制定心理咨询师职业资格认证的政策、法规和标准，组织实施心理咨询师资格考试，对合格人员颁发资格证书。

2、中国心理卫生协会：作为心理咨询行业的全国性组织，中国心理卫生协会负责组织和管理心理咨询师职业资格认证工作，协助国家卫生健康委员会开展心理咨询师资格考试，对合格人员进行资质认定。

3、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会：各省、自治区、直辖市卫生健康委员会在国家卫生健康委员会的指导下，负责本行政区域内心理咨询师职业资格认证工作的具体实施，包括组织考试、审核报名材料、发放证书等。

4、各地心理卫生中心、医院、职业培训机构等：各地心理卫生中心、医院、职业培训机构等作为心理咨询师培训的主体，负责组织和开展心理咨询师培训课程，协助参加培训的人员报名参加资格考试。

5、一些专业的心理咨询师培训机构：为了满足市场需求，一些专业的心理咨询师培训机构也提供心理咨询师资格证培训课程，帮助学员通过考试获得资格证书，这些机构通常与国家卫生健康委员会、中国心理卫生协会等权威机构合作，确保培训质量。

心理咨询师资格证的发放主要由国家卫生健康委员会负责，各省、自治区、直辖市卫生健康委员会、各地心理卫生中心、医院、职业培训机构等各级机构共同参与，确保心理咨询师职业资格认证工作的顺利进行，在选择心理咨询师培训机构时，建议考生选择具有权威性和专业性的机构，以保证培训质量和后续职业发展。