心理咨询师证书是由多个部门或机构发放的，具体包括以下几个方面：

1、国家人力资源和社会保障部：作为国家级职业资格证书，心理咨询师证书由国家人力资源和社会保障部负责颁发和管理，该部门负责制定心理咨询师职业技能标准和考试大纲，组织全国范围内的考试和评审工作，并对合格者颁发证书。

2、各省、自治区、直辖市人力资源和社会保障厅(局):作为地方性职业资格证书，心理咨询师证书在各省、自治区、直辖市也由当地的人力资源和社会保障厅(局)负责颁发和管理，这些部门会根据国家统一的标准和要求，结合本地实际情况，制定相应的考试大纲和评审办法，对参加考试并符合条件的人员进行认证和颁发证书。

3、各大高校心理咨询中心：一些高校设有心理咨询中心，为学生提供心理咨询服务，这些中心通常也会开展心理咨询师培训和考试工作，并对合格者颁发证书，一些高校还会与国内外知名的心理咨询机构合作，共同开展心理咨询师培训项目，为学员提供更专业的学习资源和支持。

4、国际心理咨询师协会(IPA):国际心理咨询师协会是一个专门从事心理咨询师资格认证工作的国际组织，其发放的证书被广泛认可和接受，IPA在全球范围内设有多个分支机构和考试中心，可以为来自不同国家和地区的学员提供考试和服务。

5、其他专业心理咨询机构：除了以上几个主要的发放机构外，还有一些专门从事心理咨询师培训和认证工作的机构，如中国心理卫生协会、中华医学会心理科分会等，这些机构也会开展心理咨询师培训和考试工作，并对合格者颁发证书。

心理咨询师证书的发放涉及多个部门和机构，需要遵循国家统一的标准和要求，同时结合各地实际情况进行具体操作，对于有意成为心理咨询师的人员来说，可以根据自己的需求和条件选择合适的培训机构和发证机构进行学习和考试，通过获得心理咨询师证书，不仅可以提高自身的专业素质和竞争力，还可以为广大有需要的人提供更好的心理咨询服务。