中医调理师资格证书是国家对从事中医调理工作的人员进行资格认证的一种证书，其发放部门主要有两个，分别是国家中医药管理局和人力资源和社会保障部，这两个部门都是经过国务院批准设立的，具有很高的权威性，国家中医药管理局主要负责中医药行业的管理、监督和政策制定等工作，而人力资源和社会保障部则主要负责人力资源和社会保障方面的工作，包括职业资格证书的颁发等。

国家中医药管理局是中华人民共和国国务院直属机构，负责全国中医药事业的管理和监督工作，其前身是中华人民共和国卫生部中医药管理局，成立于1959年，2008年，根据国务院机构改革方案，原卫生部中药局、卫生部食品药品监管局和原国家药品监督管理局中药民族药品管理司合并组建成立国家中医药管理局，国家中医药管理局的主要职责包括：制定中医药事业发展规划和政策；组织实施中医药标准化、现代化建设；加强中医药科研和技术创新；开展中医药人才培养和管理；指导和监督中医药服务体系建设等。

人力资源和社会保障部是中华人民共和国国务院组成部门之一，负责全国人力资源和社会保障工作的管理和监督，其前身是中华人民共和国劳动部，成立于1949年，2008年，根据国务院机构改革方案，原劳动部、社会保障部和卫生部的部分职能整合组建成立人力资源和社会保障部，人力资源和社会保障部的主要职责包括：制定人力资源和社会保障事业发展规划和政策；组织实施人力资源和社会保障制度改革；加强人力资源和社会保障系统队伍建设；指导和监督社会保险、社会救助、劳动关系协调等方面的工作等。

虽然国家中医药管理局和人力资源和社会保障部都是具有很高权威性的部门，但在中医调理师资格证书的发放上，二者还是有所区别的，国家中医药管理局主要负责对中医药行业从业人员的资格认证，包括中医师、中药师、中针灸师等，而人力资源和社会保障部则主要负责对整个人力资源市场的管理和监督，包括职业资格证书的颁发等，从专业性角度来看，国家中医药管理局发放的中医调理师资格证书可能更具权威性。

中医调理师资格证书的发放部门主要是国家中医药管理局和人力资源和社会保障部，这两个部门都是经过国务院批准设立的，具有很高的权威性，在实际操作中，可以根据个人需求和实际情况选择合适的发放部门，获得中医调理师资格证书不仅能够提高个人的专业素质和竞争力，还有助于推动中医调理事业的发展和传承。