中医康复理疗师资格证发证部门是指负责对中医康复理疗师进行资格认证的官方机构，中医康复理疗师资格证的发放和管理主要由国家卫生健康委员会(原卫生部)负责，国家卫生健康委员会是国务院组成部门，下设多个局和司，其中就包括中医药管理局，负责全国中医药事业的发展和管理。

在中医药管理局下设有一个专门负责中医康复理疗师资格认证的部门，名为“中医药行业职业技能鉴定指导中心”，该中心的主要职责是对中医康复理疗师进行资格认证、技能培训和考核工作，该中心还负责制定中医康复理疗师的职业技能标准、编写培训教材和辅导资料等工作。

中医康复理疗师资格证的发放和管理遵循严格的程序和标准，申请人需要参加由中医药管理局认可的培训机构开设的中医康复理疗师培训课程，并通过考试取得合格成绩，申请人需提交相关材料，包括身份证明、学历证明、培训成绩单等，以便进行资格审核，经过审核合格后，申请人可以参加由中医药管理局组织的中医康复理疗师职业技能鉴定考试，考试合格者，将获得中医康复理疗师资格证书。

获得中医康复理疗师资格证的人员，可以在医疗机构、康复中心、养老院等地方从事中医康复理疗工作，他们还可以选择继续深造，提升自己的专业技能和水平，可以通过参加更高级别的培训课程、考取高级职称等方式，逐步晋升为高级中医康复理疗师、副教授、教授等职务。

中医康复理疗师资格证发证部门是国家卫生健康委员会及其下属的中医药行业职业技能鉴定指导中心，通过这个部门的认证和考核，可以确保中医康复理疗师具备一定的专业素质和技能水平，为患者提供优质的中医康复服务。