农艺师证书是由国家相关部门颁发的，主要目的是为了规范农业行业的职业资格认证，提高农艺师的专业素质和技能水平，农艺师证书的颁发主要由以下几个部门负责：

1、国家农业农村部（原农业部）：作为中国农业行业的主管部门，国家农业农村部负责制定农业行业的相关政策、法规和技术标准，对农艺师的培训、考核和认证工作进行指导和监督，国家农业农村部下属的各级农业行政主管部门，如省、市、县农业局等，也承担着农艺师证书的颁发工作。

2、国家职业技能鉴定中心：国家职业技能鉴定中心是国家级的职业资格认证机构，负责组织和管理全国范围内的职业技能鉴定工作，农艺师证书的颁发和管理工作，需要与国家职业技能鉴定中心密切配合，确保农艺师证书的权威性和有效性。

3、农业职业技术教育培训机构：农业职业技术教育培训机构是农艺师培训和考核的主要场所，负责为农艺师提供系统的培训课程和实践操作指导，这些培训机构通常由国家农业农村部、地方农业行政主管部门或企事业单位设立，具有一定的资质和实力。

4、农业科研院所和高校：农业科研院所和高校在农艺师培训和认证工作中发挥着重要作用，他们拥有丰富的农业科研资源和教学经验，可以为农艺师提供专业、系统的培训课程和实践操作指导，农业科研院所和高校还可以与国家职业技能鉴定中心合作，共同推动农艺师证书的颁发和管理工作。

农艺师证书的颁发程序一般包括以下几个环节：

1、报名：农艺师申请人首先需要向国家农业农村部或其下属的农业行政主管部门、农业职业技术教育培训机构、农业科研院所和高校等相关单位报名参加农艺师培训和考核。

2、培训：报名成功后，农艺师申请人需要参加为期数周至数月的农艺师培训课程，学习农业相关的理论知识和实践操作技能，培训课程通常包括农作物种植、病虫害防治、土壤肥料管理、农业机械操作等内容。

3、考核：培训结束后，农艺师申请人需要参加由国家职业技能鉴定中心或相关单位组织的农艺师考核，考核形式通常包括理论考试和实践操作考核两部分，考核内容涵盖培训课程的各个方面。

4、颁发证书：农艺师考核合格后，农艺师申请人可以向国家农业农村部或其下属的农业行政主管部门、农业职业技术教育培训机构、农业科研院所和高校等相关单位申请颁发农艺师证书，证书上会注明农艺师的姓名、性别、出生日期、证书编号、发证单位、发证日期等信息，具有法律效力。

农艺师证书的颁发涉及到国家农业农村部、国家职业技能鉴定中心、农业职业技术教育培训机构、农业科研院所和高校等多个部门和单位，旨在提高农艺师的专业素质和技能水平，促进农业行业的发展。