“药王”孙思邈的《千金方》中就清楚地记载着：艾灸应当遵循先阳后阴，先左后右，向上后下的原则。中国古代先民多以农耕为作，脸朝黄土背朝天，因此，中医将背部、上身归之于阳；腹部、下身归之于阴。在阴阳学说中，头为阳、足为阴；左为阳、右为阴。

所以按照传统的中医理论，施行灸疗的顺序，一般是先灸上部，后灸下部；先灸背部，后灸腹部；先灸头身，后灸四肢；先灸左侧，后灸右侧。中医讲究辩证施治，有些疾病的调理灸疗顺序也不是一成不变，可以先缓解症状，比如先灸阿是穴和其他重点穴位等。总之是以人为本，患者舒适为宜。据《内经·灵枢》记载：古人又将一天分为春夏秋冬四个时期，早晨为春、日中为夏、日落为秋、半夜为冬。一般来说，晚9点到凌晨3点是一天的冬季，叫日冬；凌晨3点到上午9点是一天的春季，叫日春；上午9点到下午3点是一天的夏季，叫日夏；下午3点到晚上9点是一天的秋季，叫日秋。早晨人的精气神开始生发，病易入体；日中人的精气神最旺，能战胜病邪。所以在一天中灸疗的最佳时间是在午时之前或者之后。所以，药物加穴位，再加上一个较为恰当的治疗时机，三者完美地结合，才能让灸疗获得更好的治疗效果。